《轩辕剑》的故事明显受到当时以民间传说为题材的电影《倩女幽魂》的影响，游戏中三位主角的名字甚至都采用了电影中的名字，同时，由于蔡明宏受到兵役的影响，使得故事的剧情草草结束，但是操作简单、支持VGA显示的画面在当时显得十分精美，同时由于当时同类游戏的缺乏，使得其采用的流行元素反而也受到了广大玩家的欢迎。一代游戏建立了整个系列的框架，即以上古神话传说为背景，讲述神、魔、人三界的斗争。这个世界观为后代所延续，其中的那把轩辕剑更成为贯穿每一代故事的主线。一代的游戏讲述了上古之后，人类的快速发展缩小了神魔两界的生存空间，恶神决定消灭人类，但是由于善神的反对使得人类逃过了浩劫，数千年后，妖魔开始攻击人类，此时出现一位拿着轩辕剑的侠士，组织众人成为一支抗魔军，压制住妖魔的攻势。然而在善恶两神联手之下，抗魔军最终失败了，人类在恶魔的阴影下生活了十六年，直到轩辕剑侠之子燕赤霞出现，打败了妖魔，拯救了人类。